La prima volta che Cydia viene aperta comparirà la scritta "initialize filesystem", ovvero l'app deve inizializzare i suoi archivi. Questo processo può richiedere diversi minuti e al suo termine Cydia si chiuderà. A questo punto riavviate l'applicazione e impostate voi stessi come User principali. Se esistono degli aggiornamenti, Cydia lo verificherà e li scaricherà autonomamente.
Quando viene richiesto di aggiornare il database di Cydia (ovvero quando compaiono le opzioni "Upgrade Complete" o "Upgrade Essentials"), procedere come indicato.
Quando il download è completato, riavviare Cydia. A questo punto sfruttare la vostra applicazione!!